Loading…

Limpiar Filtros

domingo Sala S4 - SUG y SBF
09:00 - 10:45 SUG
Simposio SUG_4: Genética Evolutiva y diversidad
 Coordinadora
Graciela García de Souza - Sección Genética Evolutiva, Facultad de Ciencias (Uruguay)
 Coordinador
Mariana Cosse -
09:00 - 09:50: Zonas híbridas: origen de biodiversidad vs. delimitación de especies y stocks.
 Expositora
Graciela García de Souza - Sección Genética Evolutiva, Facultad de Ciencias (Uruguay)
09:50 - 10:10: Frecuencias de las inserciones alu tpa25, ace y apoa1 en la población de Tacuarembó, Uruguay.
 Expositor
Yasser Ventura Vega Requena - Centro Universitario de Tacuarembó (Uruguay)
10:10 - 10:30: Sex determination and differentiation genes in the Siberian sturgeon derived from a transcriptome study.
 Expositora
Denise Vizziano Cantonnet - Instituto de Biología Fac. de Ciencias UdelaR (Uruguay)
| Conferencista invitado
Zonas híbridas: origen de biodiversidad vs. delimitación de especies y stocks (#0086)
Graciela García de Souza 1
1 - Sección Genética Evolutiva, Facultad de Ciencias.
Resumen:
    La biodiversidad es el resultado de los procesos de especiación y extinción. Importantes preguntas se generan en torno a determinar cómo un proceso continuo de cambios puede producir grupos discretos a los que denominamos especies. Por este motivo, los procesos y mecanismos que conducen a la formación de estas entidades biológicas  están en permanente revisión. Esto se debe a nuevas capacidades de análisis aportadas por la genética molecular, la genómica y otras “òmicas” y a importantes desarrollos conceptuales en campos como la sistemática y la genética de poblaciones. Los límites específicos pueden ser definidos como fenotipos/genes/regiones genómicas que permanecen diferenciadas en fase de la potencial hibridación e introgresión. Los límites específicos son semipermeables (“porosos”),  en dónde la permeabilidad (intercambio genético) es función de la región genómica considerada. Las evidencias tempranas de la existencia de límites específicos semipermeables entre taxones emparentados, proceden de las evidencias de introgresión diferencial en zonas híbridas. Una zona híbrida es un área en donde se encuentran y reproducen poblaciones divergentes, produciéndose al menos en parte de su progenie, mezcla entre diferentes linajes genéticos. Desde el punto de vista de la Biología Evolutiva, las zonas híbridas son áreas consideradas como "laboratorios naturales, “ventanas de los procesos evolutivos”. En este trabajo presentamos la contraposición entre 2 modelos de estudio en peces endémicos de la región Neotropical, con evidencia de zonas de contacto primario o secundario, ambos procesos de diferenciación reciente de tipo Post-Pleistocénico. Por un lado, el grupo de especies continentales de peces anuales del género Austrolebias y por otro,  peces estuarinos tales como el pejerrey del genéro Odontesthes. En ambos casos, la diversidad genética encontrada y los procesos de hibridación natural detectados, representan un desafío en la diferenciación específica, delimitación de especies y stocks, así como en la definición de Unidades para la conservación.    

Contacto: ggarcia@fcien.edu.uy
--//--

| Póster | Oral - No
FRECUENCIAS DE LAS INSERCIONES Alu TPA25, ACE Y APOA1 EN LA POBLACIÓN DE TACUAREMBÓ, URUGUAY (#0324)
Yasser Ventura Vega Requena 1; Pedro C HIdalgo 1; Sara Flores 1; Monica Sans 2
1 - Centro Universitario de Tacuarembó - UDELAR. 2 - Facultad de Humanidades y Ciencias de la Educación - UDELAR.
Resumen:
Introducción. Tacuarembó está ubicado al Nordeste del país, ocupa el territorio más extenso entre los 19 departamentos, fue uno de los asentamientos de las poblaciones indigenas que existieron en el Uruguay (Charruas, Minuanes y Guaraníes). La región ha sido poblada con oleadas sucesivas de migrantes principalmente de origen Español e Italiano y por Africanos y Portugueses, provenientes del Brasil. Los estudios para determinar la ancestralidad de esta población con marcadores clásicos y uniparentales han demostrado su composición tri-híbrida lo que refleja parte de su historia. Las inserciones Alu, son marcadores de ADN estudiados ampliamente en distintas poblaciones a nivel mundial ya que proporcionan una valiosa información para estudios de ancestralidad y diferenciación genética de las poblaciones humanas. El objetivo de este trabajo fue estimar las frecuencias alélicas de tres inserciones Alu (APOA1, ACE y TPA25) en la población de Tacuarembó y su comparación con las frecuencias reportadas previamente en la población de Montevideo. Materiales y Métodos. Se estudió una muestra de 64 individuos no emparentados naturales de Tacuarembó. El ADN fue extraído de sangre. Se determinaron los genotipos por PCR y electroforesis en agarosa. Las frecuencias alélicas y AMOVA se calcularon con el programa GenAlEx v.6.5. Resultados. En la población Tacuarembó se estimó para APOA1 una frecuencia de la inserción de 0,82, para ACE de 0,27 y para TPA25 de 0,367. La mayor diferencia en las frecuencias alélicas al comparar Tacuarembó con Montevideo fue para el locus TPA25 (0.367 vs 0.278 respectivamente). La media del coeficiente de diferenciación (Fst) entre Tacuarembó y Montevideo fue del 0.40%. Conclusión. Los resultados obtenidos en las muestras analizadas para las tres inserciones Alu no indican diferencias significativas entre la población de Montevideo y Tacuarembó.

Contacto: yassve2@gmail.com
--//--

| Póster | Oral - Si
Sex determination and differentiation genes in the Siberian sturgeon derived from a transcriptome study (#0050)
Christophe Klopp 1; Santiago Di Landro 2; André Lasalle 2; Frédéric Escudié 1; Clémence Genthon 1; Denise Vizziano Cantonnet 2
1 - INRA. 2 - Facultad de Ciencias, UdelaR.
Resumen:
Sturgeons are target species for caviar production and are considered among the most valuable commercial fishes. Studying sex determination and differentiation is an important issue to understand their biology and has applications both in fish conservation and production. The goal of this work is to identify genes involved in Siberian sturgeon sex determination and differentiation. A gonad transcriptome database has been build after sequencing and assembling 15 samples of gonads coming from fish at undifferentiated stages (critical period of sex change) from 3 to 5 months old, mo) and differentiated male and female  (>8 mo). A candidate gene strategy approach was applied to identify pro-testis and pro-ovarian genes involved in sex differentiation as well as sex determinant genes described for vertebrates.  Expression level of genes selected in reads per million was compared statistically between stages and sexes. Sex determinant genes searched were not present at stages studied. A first set of pro-testis genes involved in somatic cell proliferation and androgen synthesis and regulation had maximum expression levels at 3 mo (sox9, irr, dhh, sdr5a2, cyp11c), while a second set dax1, gata 4, fog2 were highly expressed later at 5-6 mo together with lhx9, sf1 and mfge8 which are involved basically in Sertoli and Leydig cell development. In putative females, beta-catenin is highly expressed at undifferentiated stage  while a second set of pro-ovarian genes were over expressed (aromatase, fst, foxl2, hsd17b1) at 5-6 mo. Steroid synthesis genes expression shows an early potentiality these hormones. Our data shows that pro-ovarian genes and estrogen synthesis potentiality appear very early in ancient fish and remain conserved in modern fish, but pro-testis genes detected in sturgeons are more closely related to male pathways described in mammals than those described in modern

Contacto: vizziano@gmail.com
--//--

10:45 - 11:00
CAFÉ
11:00 - 12:30 SNU
Asamblea de socios SNU
12:30 - 14:00
ALMUERZO (CARPA C8)
14:00 - 14:45 SBF
PRESENTACIÓN POSTERS (C9) - SBF - #0028, #0164, #0174
| Póster | Oral - Si
Modulación de genotoxicidad por la enzima Topoisomerasa-II (#0028)
Marzia Fasanello 1; Daniel Martinez 1; Olga Lillo 1
1 - Lab de Radiobiologia-Depto Biofisica-Fac de Medicina- UdelaR.
Resumen:
Las Topoisomerasas catalizan corte y unión de las hebras de ADN, permitiendo el pasaje de una sobre la otra para liberar la tensión generada por el super-enrollamiento. El objetivo del presente trabajo fue estudiar el rol de la Topoisomerasa-II en relación a letalidad y mutagenesis inducidas por radio-quimioterapia tumoral. Los agentes usados fueron: cisplatino (genera principalmente aductos con el ADN y uniones covalentes intercatenarias), y rayos-X (generan principalmente roturas simples y dobles de las hebras de ADN). Se trabajó con poblaciones del eucariota Saccharomyces cerevisiae: cepa silvestre JN-362a y cepa isogénica deficiente en Topoisomerasa-II JN-362a-top2, ambas auxotróficas para adenina. Las dosis fueron: para cisplatino 1mM-3mM y para rX 40-120 Gray. Los tratamientos fueron realizados en medio nutriente líquido y en fase de crecimiento exponencial. La frecuencia relativa de sobrevivientes fue determinada mediante las colonias formadas en medio nutriente sólido y la frecuencia mutagénica (reversión ade→ADE) se determinó mediante el número de colonias formadas en medio sólido sin adenina. Se observó que, sometida a cisplatino, la cepa JN-362a-top2 presento menor sobrevida y mayor mutagénesis que la cepa JN-362a, acorde a lo esperado. Sorprendentemente, expuesta a rX, la cepa deficiente en Topoisomerasa-II presentó mayor sobrevida y menor mutagénesis que la silvestre. Postulamos, para el caso de daños generados por rX, que la presencia en concentraciones normales de Topoisomerasa-II permite un amplio e inespecífico acceso a enzimas de reparación dando lugar a la acción de aquellas error prone. Para el caso de daños generados por cisplatino la presencia de Topoisomerasa-II favorece la acción de enzimas más específicas y eficientes. Estos resultados preliminares sugieren que, además del tipo de daño del ADN, el estado topológico de esta macromolécula determina el grupo enzimático que procesa sus lesiones.

Contacto: mrfasanello@gmail.com
--//--

| Póster | Oral - No
Comparative genomics of miRNAs in Cestodes (#0164)
Santiago Fontenla 1; Alicia Costabile 2; Guillermo Lamolle 1; Estela Castillo 2; José Tort 1
1 - Facultad de Medicina-UdelaR. 2 - Facultad de Ciencias-UdelaR.
Resumen:
Background: Cestode parasites are responsible for various worldwide zoonosis of great public health concern. Meanwhile, other tapeworms like Mesocestoides corti are an interesting model for the study of developmental biology. As genomic sequences of parasitic helminths are becoming available, novel questions regarding gene expression, development and their regulation are now possible. Small RNAs have been proven to modulate the gene expression in different organisms and while they have been sequenced in numerous Cestodes, little is known about their role in development and gene regulation on these species.   Results: To gain some insights on the expression profile of miRNAs through the life cycle, we compared already published data of six cestode species adding a novel dataset of M. corti. We found that, although miRNA expression varies between species and stages, there is a reduced set of miRNAs that are highly expressed at all moments probably acting as regulatory housekeeping. Since draft genomes are available we compared the genomic location of identified miRNAs, and found that while genomic location is conserved within cestode, synteny is less conserved respect to more distant species like trematodes. To further characterize if there are miRNAs conserved among platyhelminthes that have not been reported yet, we made a de-novo miRNA prediction on four flatworm genomes. To assess possible functions of the miRNAs detected we used the M. corti dataset to predict putative targets on 3’UTRs of annotated transcripts. Then, to verify the functional correlation of predictions, we look the annotation of predicted targets of a set of miRNAs that were reported to be differentially expressed between two developmental stages.   Conclusions: This work is the first attempt to describe and functionally analyze the miRNA role in the development of cestodes. This will be potentially useful in the design of new strategies of control.

Contacto: sfontenla@fmed.edu.uy
--//--

| Póster | Oral - Si
Efectos antiproliferativos de aceite esencial de Eugenia uniflora L. (Pitanga) (#0174)
Gabriela Ferragut 1; Ana Gabriela Sánchez 1; Pamela Lombardo 2; María Angélica Severi 1; Juan Antonio Cedano 1; Beatriz Vignale 2; Alvaro Vázquez 3; Eduardo Dellacassa 3; Déborah Keszenman 1
1 - CenUR Litoral Norte-Salto. 2 - CenUR Litoral Norte-Salto-EEFAS. 3 - Fac. Química.
Resumen:
Se estima que 80% de los habitantes de la tierra dependen de la medicina folklórica para sus necesidades de atención primaria que en su mayor parte implica el uso de plantas. En países desarrollados, la medicina basada en el uso de productos naturales ha ganado popularidad en parte por la creencia de que son productos seguros, están asociados a una vida saludable y son “amigables con la naturaleza”. A pesar de su potencial uso terapéutico, aún queda mucho por ser estudiado especialmente en relación a sus posibles efectos adversos o tóxicos. Se ha demostrado que diversas plantas presentan un amplio espectro de actividades biológicas antiinflamatorias, antioxidantes y anticarcinogénicas. Entre las enfermedades crónicas que afectan la población mundial, el cáncer constituye una de las principales causas de morbilidad y mortalidad. Por tanto, la investigación de las plantas o sus derivados como fuente de agentes terapéuticos o preventivos de la carcinogénesis es de alta relevancia.  Recientes estudios en células humanas indican que los aceites esenciales de hojas de Pitanga tienen propiedades antioxidantes pero carecen de efectos citotóxicos o genotóxicos. Bajo la hipótesis de que E.uniflora constituye una fuente de agentes moleculares que pueden prevenir la iniciación y/o progresión tumoral, hemos estudiado los efectos antiproliferativos del aceite esencial de hojas de Pitanga. Este se obtuvo por hidrodestilación a partir de hojas jóvenes del árbol VIII.7 localizado en la Estación Experimental de Facultad de Agronomía, Salto. Usando Saccharomyces cerevisiae, se determinó la cinética de proliferación de poblaciones celulares control y tratadas con aceite esencial de E.uniflora. Se observó modificación de la cinética de proliferación celular concentración dependiente. La determinación de la viabilidad celular durante el estudio de proliferación demostró la ausencia de efecto citotóxico. Estos resultados sugieren una alteración del ciclo celular como causa del retardo o inhibición de la proliferación celular.

Contacto: gferragu@fq.edu.uy
--//--

14:45 - 15:30 SUG
PRESENTACIÓN POSTERS (C9) - SUG - #0048; #0049; #0324; #0303; #0123
| Póster | Oral - No
Analysis of transposable elements expressed in the gonads of the Siberian sturgeon   (#0049)
Frédéric Brunet 1; Alexia Roche 1; Domitile Chalopin 1; Magali Naville 1; Christophe Klopp 2; Denise Vizziano Cantonnet 3; Jean Nicolas Volff 1
1 - Université de Lyon. 2 - INRA Toulouse. 3 - Universidad de la República Fac. Ciencias.
Resumen:
Sturgeon caviar has become seafood production with strong economic production in aquaculture (Diana 2009). Along with any economy raising, illegal and deceitful products might be encountered, e.g. mix caviar of different species sold to the price of the most expensive one. Knowing transposable elements (TEs) repertoire can be used as a strategy to figure out whether caviar is made of only one or various sturgeon species using different approaches: phylogenetic studies as made in the present work, inventory of non active TE at species-specific positions along the orthologous genomic regions of sturgeons, TE PCR amplification and sequencing looking for TEs specificity. Transposable elements (TEs) are mobile and repeated sequences that are major factors of diversity and evolution in genomes. We report here through the analysis of gonad transcriptomes of the Siberian sturgeon Acipenser baerii, a non-teleost ray-finned fish, that sturgeon genomes contain many families of TEs, which are expressed in gonads and might be involved in the evolution of this divergent fish lineage. The high diversity of TEs observed in sturgeons, which is also found in teleost fish, coelacanth and amphibians but not in birds and mammals, strongly supports that many TE families were present in ancestral vertebrate genomes. Two types of transposable elements potentially differing in their evolutionary dynamics have been further characterized: DIRS-like retrotransposons, with a single lineage mainly transmitted vertically, and Tc1/mariner DNA transposons, with multiple lineages and the possible involvement of horizontal transfer. This first global analysis is a new step toward the understanding of TE evolution and evolutionary impact in non-teleost ray-finned fish, and will help to annotate the upcoming sequences of the large sturgeon genomes.

Contacto: vizziano@gmail.com
--//--

| Póster | Oral - No
Siberian sturgeon multi-tissue transcriptome database   (#0048)
Christophe Klopp 1; Andre Lasalle 2; Santiago Di Landro 2; Cedric Cabau 1; Frederic Brunet 3; Jean Nicolas Volff 3; Denise Vizziano Cantonnet 4
1 - INRA. 2 - Facultad de Ciencias. 3 - Université de Toulouse. 4 - Universidad de la República.
Resumen:
Sturgeons are target species for caviar production and considered among the most valuable commercial fishes. They are found and cultured in the northern hemisphere and were introduced for production in the southern hemisphere > 20 years ago. They are also important to study vertebrate genomes evolution because their genome probably underwent a Whole Genome Duplication enabling the emergence of new gene functions. Their large genomes are still difficult to assemble. Multi-tissues transcriptomic resources are therefore an alternative to study physiological and molecular controls of different process such as reproduction, growth or nutrition. A multi tissue database (stomach, liver, kidney, heart, muscle, brain, hypophysis, gonads, skin, swimming bladder) was built for Acipenser baerii. Four different transcriptome de novo assemblies have been produced with DRAP with two assemblers (Trinity and Oases) and two strategies: read sets merging and per tissue assembled contigs merging. The resulting assemblies have been compared on several metrics including contigs count, total nucleotide count, read realignment rate, number of Lepisosteus oculatus proteins reconstructed with at least 80% identity and 80% protein length, BUSCO and transrate scores. The best assembly includes 71,263 contigs for a total length of 118,836,837 bases and a mean contig size of 1,667 nucleotides; and between 91% and 98% of the reads map to the contigs depending on the tissue. It includes 95% of the 2586 searched BUSCO genes. This assembly has been annotated with different databases such as Uniprot-Swissprot, refseq-protein, Gadus morhua, Lepisosteus oculatus, Danio rerio, Oryzias latipes, Homo sapiens Ensembl proteins. It has also been processed with InterPRoScan, RNAmmer and tRNAScanSE. Reads have been realigned on the contigs to produce expression levels as well as SNPs and INDELs. The variations have been functionally annotated. All the results have been uploaded in an RNABrowse instance which will be accessible at http://sturgeontissuedb.sigenae.org.

Contacto: vizziano@gmail.com
--//--

| Póster | Oral - Si
Caracterización Morfológica y Molecular de Variedades Italianas de Olivo (Olea europea L) instaladas en el Jardín de Introducción de INIA “Las Brujas”. (#0123)
Jennifer Bernal 1; Jorge Pereira 2; Paula Conde 3
1 - Facultad Agronomía. 2 - Facultad de Agronomía. 3 - Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria.
Resumen:
Caracterización Morfológica y Molecular de Variedades Italianas de Olivo (Olea europea L) instaladas en el Jardín de Introducción de INIA “Las Brujas”. 1Bernal, J., 2Conde, P., y 1Pereira, J. 1Departamento Biología Vegetal, Facultad Agronomía, Av. Garzón 780, 12900 Montevideo, , Uruguay 2Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria, Las Brujas. Uruguay. La olivicultura se desarrolla en Uruguay desde fines del siglo XVIII, y a partir de 1990 adquiere una gran expansión con nuevas plantaciones y variedades introducidas desde el área Mediterránea. En el año 2002, el Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria, comienza la instalación de un Jardín de Introducción de Variedades de diversas procedencias, con la finalidad de evaluarlas agronómicamente en las condiciones de nuestro país. Con el objetivo de asegurar la identidad genética a esas variedades, se realizaron, análisis que permitieran corroborar los nombres de las mismas. Este requisito es corriente en cualquier Banco de Germoplasma o Jardín de Introducción, a los efectos de darle mayor seguridad a los resultados de las evaluaciones de estos materiales genéticos, ya que son frecuentes en el proceso de importación, errores de etiquetado o nomenclatura. En este trabajo se caracterizaron diez y seis variedades procedentes de Italia, plantadas en el año 2005. Se analizaron características morfológicas de hoja, fruto y endocarpo a 40 muestras por variedad. Asimismo se aplicaron diez pares de microsatélites diseñados para olivos, evaluados en otros ensayos realizados en bancos de germoplasma de referencia como los más discriminantes para el objetivo propuesto. Los resultados morfológicos y moleculares, al ser comparados con la base de datos del Banco Mundial de Germoplasma de Córdoba (España) detectaron algunos errores en los nombres asignados a las variedades analizadas, corrigiéndose la identificación. Esta caracterización confiere mayor certeza a los resultados de las evaluaciones agronómicas en curso. Trabajo financiado por INIA y Fondo de Dedicación Total (CSIC)

Contacto: jennifer.bernal4141@gmail.com
--//--

CONFERENCIA PLENARIA
17:00 - 17:30